Capsicum annuum L.
È la specie con il maggior numero di varietà e la maggior variabilità di forme, colori e dimensioni.
È coltivata in tutto il mondo.
Le caratteristiche distintive sono fiori bianchi, viola o bianchi bordati di viola e fiori/frutti singoli per nodo.
La piccantezza è media o scarsa, a volte assente (peperone dolce).
Capsicum chinense Jacq.
Comprende le varietà più piccanti.
Le caratteristiche salienti sono le foglie grandi carnose, i fiori piccoli verdognoli, i fiori/frutti multipli per nodo e la costrizione anulare nel calice.
Tipico rappresentante è l'habanero, originario della penisola dello Yucatan in Messico.
Capsicum frutescens L.
La specie comprende varietà di piccantezza medio-alta, con frutti eretti succosi che si staccano facilmente dal picciolo a maturazione.
Le foglie sono piccole e i fiori verdognoli o bianchi, con il picciolo che forma un angolo acuto alla base del calice.
Tipico rappresentante è il Tabasco, utilizzato per produrre la nota salsa.
Capsicum baccatum L.
Comprende varietà con frutti di media piccantezza e polpa spessa e croccante.
È coltivata prevalentemente in Sud America, dove le varietà sono note come Aji.
I fiori sono caratterizzati da corolla bianca con macchie gialle o verdi.
Tipico rappresentante è l'Aji amarillo.
Capsicum pubescens Ruiz & Pavon
È la specie con la minore variabilità, isolata dalle altre specie, coltivata e spontanea sulle Ande.
Le piante sono spesso imponenti con foglie pubescenti e frutti grossi con polpa spessa.
I fiori viola e i semi neri rendono le varietà di questa specie facilmente riconoscibili.
Tipico rappresentante è il Rocoto.
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